Часть коллектива завода им.Карпова, в количестве 250 человек – рабочих, служащих и ИТР прибыли  в Тюмень специальным эшелоном 16 ноября 1941г. Эвакуированный коллектив завода имени Карпова с конца 1941 года начал осваивать производство химико-фармацевтических препаратов. Не дожидаясь монтажа парового котла, коллектива завода с первых же дней освоения площадки, в существующих помещениях, в примитивных условиях, начал вырабатывать ряд весьма нужных стране медикаментов.

В самых тяжелейших условиях были освоены препараты фармакопейной чистоты: хлористый натрий; кофеин натрий бензокислый; кофеин натрий салициловый; йод сублимированный; йодгиперсол; ртуть двухлористая. На выделенной площадке организация химико-фармацевтического производства, потребовала от коллектива затрат большого труда и самоотверженности в работе. Площадка не имела  ни силового хозяйства – котельной, трансформаторной, ни надлежащего водопровода, ни канализации, ни железнодорожной ветки, ни благоустроенных подъездных путей. Расположенная на берегу реки Тура площадка ежегодно заливалась весенними паводками. Вода проникала не только на территорию площадки, но и в цеха.     

    На основании распоряжения исполкома Тюменского горсовета депутатов трудящихся от 1 декабря 1941 г . № 795 на производственных площадях мебельной артели «Победа» и территории конного двора завода «Красный Октябрь» было размещено эвакуированное оборудование Московского химико-фармацевтического завода имени Л.Я.Карпова.       

    Народным комиссариатом Здравоохранения СССР, в системе которого находился завод, присвоено эвакуированному заводу новое название «завод №39». При этом был спад производства. В этот период завод собирались закрыть – экология, береговая зона, устаревшие мощности. Первый устав предприятия утверждён заместителем народного комиссара здравоохранения Союза ССР 27 февраля 1942 г ., а основная государственная регистрация Государственного химико-фармацевтического завода № 39, как самостоятельного юридического лица произведена 4 августа 1942 г .       

    Из эвакуированных на Восток химико-фармацевтических заводов Тюменский завод № 39 с первого же года эвакуации полностью выполнял заданные производственные планы по выработке медикаментов необходимых армии и гражданскому населению. Спуском в июне 1942 г . парового котла, на паровой обогрев была переведена аппаратура производств хлористого натрия, солей кофеина и вновь смонтирована аппаратура для следующих производств: хлористый кальций кристаллический; хлористый аммоний чистый, сернокислый аммоний чистый; йодоформ; натр едкий чистый; гидроксель; новарсенал (последняя стадия); ртуть однохлористая; ртуть амидохлорная; серебро коллоидальное.     

   До 1948 года Министерство здравоохранения СССР в системе которого находился завод, не решало вопроса о дальнейшей судьбе завода.Существовало мнение: - ликвидировать завод как производственную единицу системы Здравоохранения СССР, ввиду относительно малой мощности производства и отдалённости от научного и руководящего центра. В 1948 году Министерство здравоохранения СССР окончательно приняло решение, что завод № 39 остаётся в г.Тюмени как производственное предприятие министерства, переименовав завод № 39 в Тюменский химико-фармацевтический завод.     

   В связи с данным решением была пересмотрена номенклатура препаратов вырабатываемой заводом с увязкой с общим планом специализации химико-фармацевтических заводов. С номенклатуры завода были сняты многие препараты более подходящие по специализации других заводов, а Тюменскому химфармзаводу были в значительной степени увеличены задания по выработке медицинских неорганических солей и расширена номенклатура по выработке ртутных препаратов.     

    На основании приказа Минмедпрома СССР № 389 от 2.06.1988 г.и приказа ПХФО «Уралсинтез» № 250 от 24.06.1988 г. Об организации производственного объединения «Уралмедбиопром» был передан Тюменский химфармзавод в состав ПО «Уралмедбиопром» с 1.07.1988 г. Как самостоятельное юридическое лицо. Во исполнение Постановления Совета Министров СССР от 14 января 1976 г . № 35 «О генеральной схеме управления медицинской промышленностью», Приказом Министра медицинской промышленности СССР № 580 от 2 декабря 1977 г . Тюменский химико-фармацевтический завод был включён в состав Свердловского производственного химико-фармацевтического объединения «Уралсинтез»(объединение «Уралсинтез») в качестве производственной единицы (не являются юридическими лицами).     

    С приходом в декабре 1988 г . ныне работающего директора Морева Николая Евстафьевича, начался рост производства и увеличилась номенклатура выпускаемой продукции. Сколько понадобилось сил и энергии, чтобы отстоять родное производство, сохранить коллектив, на 80% обновить номенклатуру производства, увеличить его объёмы. Коллектив завода смог успешно преодолеть все превратности периода перехода к рыночной экономике ( Развал Союза ССР, гиперинфляция 1993-95 годов, дефолт 19 98 г .и др.) и занять серьёзное место на фармрынке России.     

    Указом Президента РФ Путина В.В. директор завода Морев Н.Е. награждён в 2002 году медалью орден «За заслуги перед Отечеством II степени».     

    В 2003 году завод произвёл рекордные объёмы лекарственных средств за всю историю завода. За последние годы освоен ряд перспективных препаратов. Наличие на заводе опытных менеджеров, грамотных специалистов и высоко-квалифицированных рабочих позволяет заводу решать проблемы перехода на стандарты GMP и планировать дальнейшее развитие завода, как производителя эффективных отечественных лекарственных средств.   

    В соответствии с Постановлением Правительства России завод преобразован в 2003 году из федерального ГУП в Открытое Акционерное общество.